Využití typicky českého webhostingu, tedy webhostingu PHP + MySQL, kombinace známé také pod zkratkou LAMP (Linux + Apache + MySQL + PHP), se postupně mění. Jednoúčelové na zakázku tvořené aplikace střídají rozsáhlé balíky aplikací, nejčastěji těch zdarma dostupných. Velký boom zažívají především open source aplikace jako WordPress, Drupal, Joomla!, ZenCart a další. Všechny se z pohledu webhostingu vyznačují především specifickými nároky na konfiguraci serveru.
Na zakázku vyráběné aplikace ale na tom nebývají o mnoho lépe – často se tvoří v některém frameworku (Zend, CakePHP nebo třeba v čechách velmi populární Nette) a jisté požadavky na konfiguraci pak vyžaduje samotný framework. Často bohužel není snadné zjistit jak požadovanou, tak ani dostupnou konfiguraci.
Základní překážkou obvykle bývá diskutabilní direktiva safe_mode, která do značné míry omezuje možnosti PHP, objevují se ale i jiná omezení – například aktuálnost verze PHP, dostupnost toho kterého rozšíření, blokování některých funkcí, nedostatečný limit velikosti paměti, krátký timeout pro vykonání skriptu, nedostatečná velikost povoleného uploadu a další.
Bohužel neexistuje snadný způsob, jak zajistit kompatibilitu vybrané aplikace s konkrétním hostingem. Pokročilí uživatelé mohou požádat podporu o odkaz na výpis funkce phpinfo() a porovnat klíčové parametry s konfigurací požadovanou pro daný software. Další možností je využít webhosting na zkoušku (mnoho firem nabízí několik týdnů zdarma nebo záruku vrácení peněz), zkusit aplikaci nainstalovat a pokud vše nebude fungovat tak, jak má, hosting zase vypovědět.